在大卫-罗宾逊伤愈复出（他因为受伤而在上个赛季仅出场6次），以及1997年nba的选秀状元蒂姆-邓肯插手以后，马刺队又再次完成了nba汗青上单个赛季上最大的胜场进步，他们赢下了56场比赛并打入了季后赛的第二轮。
而在赛季结束后别的一件事情引发了人们的存眷。先发的小前锋肖恩-埃利奥特流露他是在需求接管肾移植的环境下对峙比赛的。同一种罕见的肾部疾病作斗争的埃利奥特在8月16日接管了移植手术。他的兄弟诺尔捐募了本身的一个肾。
西部决赛，马刺迎来了最微弱的一个敌手――达拉斯小牛队。两队的比赛相称胶着，但在第二场较量中，小牛当家球星德克-诺维茨基在比赛中与马努-吉诺比利的一次相撞受伤，导致了前者随后三场比赛的缺阵。马刺顺利地4-2克服敌手，进级总决赛。总决赛敌手新泽西网队在东区决赛中以4：0横扫了底特律活塞队，坐看马刺苦战6局出线。而马刺队与网队的总决赛实在能够用“丑恶”来描述，马刺队有些漫不经心，始终保持着胜一场输一场的节拍，仿佛铁着心要在故乡球迷面前夺一回冠，邓肯永久不温不火，不知不觉持续拿下了14个两双！网队在马刺的戍守面前无所适从，主动权一向把握在马刺手中。马刺再次不出料想4：2克服了敌手，因而博得了球队汗青上第二个nba总冠军。邓肯加冕nba通例赛和总决赛双项mvp；大卫-罗宾逊带着总冠军戒指在圣安东尼奥告别了14年的nba生涯；老将史蒂夫-科尔终究能将一只手的5根手指都套满总冠军戒指了；威利斯、史女人、费里、帕克、吉诺比利、巴特尔等人也第一次亲手触摸到了奥布莱恩杯。
马刺残局并没有设想中的顺风顺水，以19－13的战绩进入一月。一月份马刺全新的体系开端逐步成型，随后在持续的9个主场比赛里拿下8场，重登榜首。马刺队一起高奏凯歌，在赛季结束前抹去了7场胜差，与达拉斯小牛队并列博得nba最好战绩。蒂姆-邓肯随后突破平局，帮忙马刺博得了队史第三个赛区冠军，本身也理所当然地博得了职业生涯第二个nba最有代价球员奖。