最后江淮局势眼看没法清算，崇祯天子只能让李焕挂帅清算残局，李焕和洪承畴一起共同，在函谷关大破闯军，李自成被杀的只剩下十几人，最后逃入商洛山中。
因为一时打动，李焕再一次在宦海当了闲人，被剥夺了兵权后授予一个闲职，整日在都城厮混。
看着昔日的闯贼摇身一变成为了和本身一模一样官兵，江淮地区的剿匪大业功亏一篑，李焕不由气的冲到总理府，抽出鞭子想给熊文灿一个经验，最后因为冲犯上官，李焕差点被罢官，最后是江北巡抚求请方才免遭此劫。
崇祯十七年，李自成先破西安然后包抄北都城，再一次成为瓮中之鳖的崇祯天子只能给李焕命令，让李焕速速带兵进京勤王，接到号令的李焕确切带兵北上，但是借口军费不敷一向未曾进京。
早已见惯了宦海暗中的李焕此时也明白过来，如果没有了闯贼，那他这个平贼将军天然也毫无用处，以是养寇为重才是正道，对于商洛山中的李自成，李焕天然也没有赶尽扑灭。
领着二十万雄师返回都城的李焕被崇祯天子重赏，崇祯天子本想持续将李焕留在北都城内，可在李焕的授意下，李自成和张献忠又开端在江南坐大，无法之下的崇祯天子只能派李焕南下弹压闯军。
占据北都城后，满清自以为天下正统，起首要断根的就是南明，为了一统天下，多尔衮派多铎统兵三十万南征，李焕亲身带兵在徐州迎敌，最后阵斩了对方大将多铎。
面对卢象升的要求，崇祯天子当即汲引李焕为正一品的平贼将军，但对于江南剿匪事件，崇祯天子则委派了熊文灿代替卢象升的六省总理，返回南边后的李焕只能在熊文灿麾下效力。
崇祯十三年冬，皇太极带领满清八旗围攻锦州，誓要打通关宁锦防地，锦州被困以后，朝廷派洪承畴挂帅，统兵二十万前去救济，洪承畴解缆前特地请崇祯天子下旨，要求李焕随他一同出征，担负粮草转运使。
跟着高迎祥的就逮，全部闯军情势急转直下，特别是滁州一战，闯军折损严峻，又没有了高迎祥这个带头大哥镇场子，各个头子谁都感觉本身有资格去争一争闯军大头领这个位置。
多尔衮占据北京正式立福临为顺治帝，李自成从北京退回陕西西安，张献忠攻占四川称帝，李焕则在南京建立南明。并立崇祯天子第二子为帝，天下堕入四分五裂的地步。