布羽士们按照《教要》详细解释，指出上帝教只是“尽行教诲教徒虔诚改过行善，以释己罪”。承审官员最不成了解的是，凡入教之人均不得为先人烧纸这一条教规，以为“仅就不准教徒为先人烧纸一事而言，确为邪教无疑”。
但是在皇家丧葬的时候，汤若望的确犯下了弥天大错，那就是利用了《蛮灭经》。
颠末一段时候的筹办，杨光先撰写了数篇文章前后上表朝廷，锋芒直指上帝教及西洋历法，但是这些弹劾并没有获得朝廷的回应。杨光先毫不泄气，乘机而动，终究在康熙初年抓住了一次机遇。
然此经曾回流于中原，幸有明师贤哲们力陈批伪，曾文辿在《青囊序》中一语道破:“三才六建虽是妙，得三失五尽为偏。盖因一行扰本国，遂把五行倒置编。以讹传讹竟不明，以是祸福为胡乱。”从而，将其称之为《灭蛮经》并再度使其失见于市。
汤若望究竟是因为甚么落空了顺治的宠幸，并且差点被凌迟正法呢？
李祖白在文中提到，中华民族的人文鼻祖伏羲本是犹太人，自西向东来到中国，并且带来了上帝教。国人该当“发展子孙，家传户习，此时此学之在中国，必倍昌明于今之世”。
礼吏二部三核定谳
刑部采信了杨光先的说法，将汤若望等人的罪名定为大逆之罪，并按照刑律提出拟措置计划：将汤若望、李祖白等钦天监官员凌迟正法；相干职员之子斩立决；不及岁之子、妻室、家人、地亩、财物等严查入官。
事情并没有到此为止，杨光先又提出来针对汤若望等人的第三项控告荣亲王葬期一事。此案触及皇家子嗣，事关严峻，其他罪名的审理都被这一控告所袒护。荣亲王是顺治帝第四子，母亲董鄂妃。【ㄨ】四皇子生下数月即短命，未及起名，后追封为荣亲王。
《灭蛮经》可追溯到唐朝，风水学作为帝王之术一向秘藏宫中由钦天监保管，但作为当时的文明交换中间长安，各国所调派的节度使及留门生已有所闻并但愿能学到此术。唐玄宗恐蛮夷知阴阳之义而助强其国势，因而命精通易理的僧一行以半真半假之法诬捏出《铜函经》，这部以“大小游年、东西四宅”为实际的伪书随之传至邻夷。
李祖白等人在挑选荣亲王下葬时候和地点的时候，不采取惯常利用的《历法黄历》和《挑选丹书》，而专门采取《蛮灭经》，其罪戾严峻，企图不言自明。
杨光先看到这篇文章后，对李祖白有辱先圣的说法大为不满，于康熙三年(1664年)7月尾做《请诛邪教状》投书礼部，以“为职官谋叛本国”和“造传妖书惑众”两个罪名控告汤若望等耶稣会士以及李祖白等奉教士人，掀起“历狱”风暴。